美国国家生物技术信息中心的基因表达数据库(GEO)项目是为了应对高通量基因表达数据公共存储库日益增长的需求而发起的。基因表达数据库(GEO)提供了灵活和开放的设计,便于从高通量基因表达和基因组杂交实验中提交、存储和检索不同类型的数据集。基因表达数据库(GEO)的目的不是要取代内部的基因表达数据库,这些数据库受益于连贯的数据集,并且构建这些数据库是为了促进特定的分析方法,而是通过充当第三级中央数据分发中心来补充这些数据库。基因表达数据库(GEO)的三个核心数...
在RNA水平,核酸编辑可以修复疾病相关的序列产生功能性蛋白质,这有望治疗遗传疾病。VI型CRISPR-Cas系统包含可编程的单效应RNA引导的RNase Cas13。在这里,研究者对VI型系统进行了分析,以设计出一种能够稳健敲除的Cas13直系同源物,并通过使用催化失活的Cas13将腺苷转为肌苷脱氨酶活性通过ADAR2引导至哺乳动物细胞中的转录物来证明RNA编辑。该系统被称为可编程A到I替换的RNA编辑(REPAIR),没有严格的序列限制,可用于编辑包含致...
摘要:本文建立了金黄色葡萄球菌多位点序列分型的方法(MLST)。从英国牛津地区社区获得性和医院获得性侵袭性疾病患者的155株金黄色葡萄球菌分离株中获得了7个持家基因的内部片段序列。本文共鉴定出53个不同的等位基因图谱,其中17种由至少两种分离株代表。MLST方案具有很高的区分性,并通过脉冲场凝胶电泳显示具有相同等位基因分布的分离株对产生非常相似的SmaI限制性片段模式来验证。所有22个等位基因分布最普遍的等位基因均为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分离株(MRSA...
文献解读